Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9BQ674R7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATG9BQ674R7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9BQ674R7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9BQ674R7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9BQ674R7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9BQ674R7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms