Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPNQ5VXI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPNQ5VXI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPNQ5VXI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPNQ5VXI9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIPNQ5VXI9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms