Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFMBT2Q5VUG0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFMBT2Q5VUG0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SFMBT2Q5VUG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SFMBT2Q5VUG0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SFMBT2Q5VUG0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SFMBT2Q5VUG0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFMBT2Q5VUG0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SFMBT2Q5VUG0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SFMBT2Q5VUG0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms