Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF220Q5VTB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF220Q5VTB9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF220Q5VTB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF220Q5VTB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms