Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC01545Q5VT33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01545Q5VT33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01545Q5VT33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01545Q5VT33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms