Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5R9

HECTD2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD2Q5U5R9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECTD2Q5U5R9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECTD2Q5U5R9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECTD2Q5U5R9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECTD2Q5U5R9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECTD2Q5U5R9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD2Q5U5R9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD2Q5U5R9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HECTD2Q5U5R9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD2Q5U5R9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECTD2Q5U5R9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms