Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF5Q5TYX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF5Q5TYX0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF5Q5TYX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms