Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATPAF1Q5TC12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF1Q5TC12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATPAF1Q5TC12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATPAF1Q5TC12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATPAF1Q5TC12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms