Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SWT1Q5T5J6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SWT1Q5T5J6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SWT1Q5T5J6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SWT1Q5T5J6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SWT1Q5T5J6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms