Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT6Q5T4J0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT6Q5T4J0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT6Q5T4J0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT6Q5T4J0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GCNT6Q5T4J0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT6Q5T4J0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT6Q5T4J0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT6Q5T4J0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT6Q5T4J0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNT6Q5T4J0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNT6Q5T4J0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms