Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECTD3Q5T447 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HECTD3Q5T447 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECTD3Q5T447 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HECTD3Q5T447 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECTD3Q5T447 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECTD3Q5T447 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms