Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAX1Q5SQQ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAX1Q5SQQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAX1Q5SQQ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAX1Q5SQQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAX1Q5SQQ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms