Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM48Q5RL73 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM48Q5RL73 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM48Q5RL73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM48Q5RL73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM48Q5RL73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms