Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms