Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NOM1Q5C9Z4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NOM1Q5C9Z4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NOM1Q5C9Z4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NOM1Q5C9Z4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NOM1Q5C9Z4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NOM1Q5C9Z4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NOM1Q5C9Z4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NOM1Q5C9Z4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NOM1Q5C9Z4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
NOM1Q5C9Z4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NOM1Q5C9Z4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NOM1Q5C9Z4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms