Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC178Q5BJE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC178Q5BJE1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC178Q5BJE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC178Q5BJE1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC178Q5BJE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC178Q5BJE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC178Q5BJE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC178Q5BJE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC178Q5BJE1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC178Q5BJE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC178Q5BJE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms