Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIN4Q56A73 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIN4Q56A73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIN4Q56A73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIN4Q56A73 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIN4Q56A73 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN4Q56A73 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms