Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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