Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGTA1PQ4G0N0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGTA1PQ4G0N0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGTA1PQ4G0N0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GGTA1PQ4G0N0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGTA1PQ4G0N0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGTA1PQ4G0N0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGTA1PQ4G0N0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGTA1PQ4G0N0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGTA1PQ4G0N0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GGTA1PQ4G0N0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGTA1PQ4G0N0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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