Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F5

VPS26B, Vacuolar protein sorting-associated protein 26B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26BQ4G0F5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS26BQ4G0F5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS26BQ4G0F5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VPS26BQ4G0F5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS26BQ4G0F5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS26BQ4G0F5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26BQ4G0F5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS26BQ4G0F5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26BQ4G0F5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26BQ4G0F5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26BQ4G0F5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26BQ4G0F5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms