Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LONRF3Q496Y0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LONRF3Q496Y0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LONRF3Q496Y0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
LONRF3Q496Y0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LONRF3Q496Y0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LONRF3Q496Y0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LONRF3Q496Y0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms