Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF212Q495C1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF212Q495C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNF212Q495C1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RNF212Q495C1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNF212Q495C1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms