Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBS9Q3SYG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BBS9Q3SYG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBS9Q3SYG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBS9Q3SYG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBS9Q3SYG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBS9Q3SYG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS9Q3SYG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms