Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY1Q3B7I2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY1Q3B7I2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY1Q3B7I2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPY1Q3B7I2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPY1Q3B7I2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY1Q3B7I2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY1Q3B7I2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY1Q3B7I2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY1Q3B7I2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY1Q3B7I2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms