Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
UVSSAQ2YD98 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UVSSAQ2YD98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UVSSAQ2YD98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UVSSAQ2YD98 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UVSSAQ2YD98 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UVSSAQ2YD98 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms