Protein–RNA interactions for Protein: Q17RY0

CPEB4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CPEB4Q17RY0 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 41.6
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CPEB4Q17RY0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.088e-6■■■■■ 36.9
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CPEB4Q17RY0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.038e-6■■■■■ 36.9
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CPEB4Q17RY0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.028e-6■■■■■ 36.9
CPEB4Q17RY0 TMEM177-206ENST00000496203 881 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 08e-6■■■■■ 36.9
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CPEB4Q17RY0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 36.9
CPEB4Q17RY0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 36.9
CPEB4Q17RY0 RBM6-220ENST00000493652 581 ntTSL 214.74□□□□□ -0.058e-6■■■■■ 36.9
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CPEB4Q17RY0 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 36.9
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