Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEP1BQ16820 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEP1BQ16820 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEP1BQ16820 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEP1BQ16820 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEP1BQ16820 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEP1BQ16820 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms