Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ME3Q16798 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ME3Q16798 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ME3Q16798 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ME3Q16798 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ME3Q16798 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ME3Q16798 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ME3Q16798 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ME3Q16798 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ME3Q16798 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ME3Q16798 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ME3Q16798 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ME3Q16798 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ME3Q16798 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ME3Q16798 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ME3Q16798 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ME3Q16798 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ME3Q16798 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ME3Q16798 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ME3Q16798 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ME3Q16798 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ME3Q16798 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ME3Q16798 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ME3Q16798 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ME3Q16798 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ME3Q16798 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ME3Q16798 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ME3Q16798 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ME3Q16798 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ME3Q16798 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ME3Q16798 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ME3Q16798 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ME3Q16798 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ME3Q16798 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ME3Q16798 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ME3Q16798 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ME3Q16798 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ME3Q16798 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ME3Q16798 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ME3Q16798 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ME3Q16798 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ME3Q16798 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ME3Q16798 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ME3Q16798 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ME3Q16798 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ME3Q16798 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ME3Q16798 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ME3Q16798 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ME3Q16798 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ME3Q16798 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ME3Q16798 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ME3Q16798 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ME3Q16798 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ME3Q16798 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ME3Q16798 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ME3Q16798 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ME3Q16798 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ME3Q16798 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ME3Q16798 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ME3Q16798 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ME3Q16798 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ME3Q16798 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ME3Q16798 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ME3Q16798 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ME3Q16798 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ME3Q16798 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ME3Q16798 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ME3Q16798 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ME3Q16798 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ME3Q16798 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ME3Q16798 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ME3Q16798 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ME3Q16798 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ME3Q16798 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ME3Q16798 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ME3Q16798 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ME3Q16798 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ME3Q16798 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ME3Q16798 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ME3Q16798 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ME3Q16798 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ME3Q16798 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ME3Q16798 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ME3Q16798 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ME3Q16798 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ME3Q16798 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ME3Q16798 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ME3Q16798 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ME3Q16798 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ME3Q16798 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ME3Q16798 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ME3Q16798 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ME3Q16798 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ME3Q16798 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ME3Q16798 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ME3Q16798 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ME3Q16798 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ME3Q16798 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ME3Q16798 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ME3Q16798 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
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