Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIF1AQ16665 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIF1AQ16665 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIF1AQ16665 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIF1AQ16665 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIF1AQ16665 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIF1AQ16665 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIF1AQ16665 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIF1AQ16665 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIF1AQ16665 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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