Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX1Q16384 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SSX1Q16384 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX1Q16384 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX1Q16384 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX1Q16384 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX1Q16384 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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