Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NCOA1Q15788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NCOA1Q15788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NCOA1Q15788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NCOA1Q15788 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCOA1Q15788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCOA1Q15788 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NCOA1Q15788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NCOA1Q15788 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCOA1Q15788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
NCOA1Q15788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
NCOA1Q15788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NCOA1Q15788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NCOA1Q15788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.03■■■■■ 4
NCOA1Q15788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NCOA1Q15788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NCOA1Q15788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NCOA1Q15788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms