Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB30Q15771 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB30Q15771 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB30Q15771 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB30Q15771 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB30Q15771 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB30Q15771 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAB30Q15771 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB30Q15771 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB30Q15771 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB30Q15771 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB30Q15771 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB30Q15771 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB30Q15771 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB30Q15771 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB30Q15771 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB30Q15771 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB30Q15771 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB30Q15771 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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