Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SURF2Q15527 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF2Q15527 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF2Q15527 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SURF2Q15527 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SURF2Q15527 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SURF2Q15527 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SURF2Q15527 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SURF2Q15527 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SURF2Q15527 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SURF2Q15527 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms