Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN3Q15417 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNN3Q15417 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNN3Q15417 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNN3Q15417 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNN3Q15417 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNN3Q15417 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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