Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKD1Q15139 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKD1Q15139 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKD1Q15139 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKD1Q15139 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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