Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARS2Q15031 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARS2Q15031 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARS2Q15031 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARS2Q15031 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARS2Q15031 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms