Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSMD6Q15008 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD6Q15008 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD6Q15008 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSMD6Q15008 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD6Q15008 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMD6Q15008 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD6Q15008 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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