Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSME4Q14997 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PSME4Q14997 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PSME4Q14997 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME4Q14997 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSME4Q14997 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSME4Q14997 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME4Q14997 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
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