Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NR1I3Q14994 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR1I3Q14994 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR1I3Q14994 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NR1I3Q14994 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1I3Q14994 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR1I3Q14994 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NR1I3Q14994 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR1I3Q14994 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR1I3Q14994 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR1I3Q14994 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR1I3Q14994 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR1I3Q14994 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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