Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NFIXQ14938 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NFIXQ14938 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NFIXQ14938 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NFIXQ14938 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NFIXQ14938 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NFIXQ14938 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NFIXQ14938 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NFIXQ14938 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NFIXQ14938 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NFIXQ14938 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NFIXQ14938 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NFIXQ14938 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NFIXQ14938 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NFIXQ14938 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NFIXQ14938 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFIXQ14938 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFIXQ14938 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NFIXQ14938 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NFIXQ14938 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
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