Protein–RNA interactions for Protein: Q14766

LTBP1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1Q14766 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP1Q14766 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP1Q14766 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP1Q14766 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms