Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-209ENST00000587727 449 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-211ENST00000588814 1719 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 211.52□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DNAJC7-204ENST00000585693 562 ntTSL 210.58□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SND1-208ENST00000470463 530 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-205ENST00000517392 2771 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 27.71□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 37.7□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 PPP4R3A-210ENST00000555718 819 ntTSL 57.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 C1QBP-207ENST00000576122 383 ntTSL 37.1□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 37.03□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-205ENST00000469890 822 ntTSL 26.04□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 55.56□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.961e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 316.73■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 27
PUM1Q14671 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 27
PUM1Q14671 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 27
PUM1Q14671 ERH-204ENST00000557697 167 ntTSL 50.82□□□□□ -2.284e-8■■■■■ 27
PUM1Q14671 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 220.2■□□□□ 0.828e-18■■■■■ 26.9
PUM1Q14671 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 214.68□□□□□ -0.068e-18■■■■■ 26.9
PUM1Q14671 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.948e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 319.11■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 417.57■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 513.06□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-207ENST00000565851 565 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.518e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 411.55□□□□□ -0.568e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 37.72□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 JPT2-212ENST00000568376 297 ntTSL 34.89□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 519.93■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 216.7■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 26.8
PUM1Q14671 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 12e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 DNMT1-227ENST00000592342 636 ntTSL 320.51■□□□□ 0.874e-8■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-215ENST00000621073 492 ntTSL 516.7■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 DNMT1-214ENST00000588118 973 ntTSL 512.63□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 DNMT1-206ENST00000586086 489 ntTSL 37.19□□□□□ -1.264e-8■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 DNMT1-210ENST00000586800 583 ntTSL 35.58□□□□□ -1.524e-8■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 DNMT1-226ENST00000592054 591 ntTSL 44.35□□□□□ -1.714e-8■■■■□ 26.7
PUM1Q14671 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.015e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.035e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.435e-8■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 215.64■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 26.6
PUM1Q14671 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-6■■■■□ 26.4
PUM1Q14671 TACO1-202ENST00000581120 2304 ntTSL 215.52■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 26.4
PUM1Q14671 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-7■■■■□ 26.2
PUM1Q14671 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 26.2
PUM1Q14671 CDC25A-203ENST00000437972 730 ntTSL 330.71■■■□□ 2.512e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 BOP1-206ENST00000569712 556 ntTSL 328.15■■■□□ 2.12e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AC074143.1-201ENST00000580114 1287 ntAPPRIS P5 TSL 525.62■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-203ENST00000461267 804 ntTSL 325.21■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-203ENST00000587627 1047 ntTSL 524.54■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 222.38■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SRM-202ENST00000459997 731 ntTSL 521.98■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-205ENST00000591196 2640 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 25.8
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 308.9 ms