Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HNF4GQ14541 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNF4GQ14541 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HNF4GQ14541 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HNF4GQ14541 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNF4GQ14541 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms