Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BECN1Q14457 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BECN1Q14457 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BECN1Q14457 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BECN1Q14457 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BECN1Q14457 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BECN1Q14457 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
BECN1Q14457 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BECN1Q14457 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BECN1Q14457 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BECN1Q14457 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BECN1Q14457 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
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