Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG2Q14126 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG2Q14126 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG2Q14126 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG2Q14126 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG2Q14126 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG2Q14126 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG2Q14126 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG2Q14126 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG2Q14126 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG2Q14126 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms