Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNIQ14094 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNIQ14094 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNIQ14094 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNIQ14094 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNIQ14094 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNIQ14094 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNIQ14094 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNIQ14094 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNIQ14094 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNIQ14094 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNIQ14094 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNIQ14094 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNIQ14094 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNIQ14094 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms