Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms