Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX1Q13596 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX1Q13596 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX1Q13596 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX1Q13596 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX1Q13596 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX1Q13596 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX1Q13596 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX1Q13596 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX1Q13596 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX1Q13596 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX1Q13596 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX1Q13596 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX1Q13596 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX1Q13596 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX1Q13596 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX1Q13596 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX1Q13596 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX1Q13596 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX1Q13596 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX1Q13596 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX1Q13596 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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