Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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