Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKRN4PQ13434 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN4PQ13434 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN4PQ13434 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MKRN4PQ13434 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN4PQ13434 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms