Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE2V1Q13404 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2V1Q13404 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2V1Q13404 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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UBE2V1Q13404 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2V1Q13404 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBE2V1Q13404 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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